種苗法は、品種を保護するためのものであり、登録された品種を権原なき第三者が育成、収穫、加工等することはできません。
商標法は、保護を受けたい商標と商品・サービスがセットになることにより、第三者がその商標をその商品・サービスに使用することはできません。
ここで、商品・サービスについては、商標法では45の区分にわかれており、例えば、「オレンジの苗木」と「オレンジの果実」、「オレンジジュース」はそれぞれ別の商品となります。
＜制度の比較＞
| 種苗法 | 法律名 | 商標法 |
| 農林水産省 | 登録先 | 特許庁 |
| 文字等（漢字、平仮名、片仮名、アルファベット、数字） | 構成 | 文字、図形、立体的形状又は これらを組み合わせたもの、色彩、音など |
| 稲、小麦などの穀物 いも類、野菜、果樹、茶、花き等の植物 |
分野 | 45区分に分類される商品・サービス |
| 果樹、材木、鑑賞樹などは30年 その他の一般的な植物は25年 |
保護期間 | 10年（更新可能） |
＜ここで注意！＞
登録品種名と商標との調整
商標法・種苗法により、登録品種とその品種の種子類、苗等の商標を同一・類似にすることはできません（商標法4条1項14号,種苗法4条1項2号、3号）。
また、登録品種とその品種の収穫物・加工品の商標を同一・類似にすることはできません（商標法3条1項3号・同法4条1項16号）。
例）登録品種「サンオレンジ」があり、商標「サンオレンジ」で商標出願した場合
| 指定商品 | 「苗木」 |
「果実、オレンジ」 |
「オレンジジュース」 |
| 登録 | ×（4条1項14号） | ×（3条1項3号又は4条1項16号） | |
| ※ただし、品種登録出願中に商標出願した場合には、以下となる。 | |||
| 登録 | ×（4条1項14号） | △（3条1項3号又は4条1項16号） ※商標審査官が登録品種と認識しない場合は登録 |
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品種登録と商標登録は１セットです。展開予定をふまえて、知財ミックスによる多面的な保護をしましょう。
保護の方策については、以下のページをご覧ください。